2005年，建華金控與台北國際商業銀行（簡稱台北商銀）合併，台北商銀以換股方式成為建華金控百分之百持股之子公司。合併後由台北商銀最大股東永豐餘集團主導營運，並於2006年更名為「永豐金融控股公司」，旗下兩家銀行（建華商業銀行與台北商銀）合併，並以建華商業銀行成為存續公司，且配合金控名稱更名為「永豐商業銀行」。
自2016 年起，陸續有內部員工檢舉，先有鼎興貿易詐貸案，隨後經檢調查證後，確認永豐金控董事被控涉及三寶建設超貸案、違法放貸給其利害關係人擔任董事之「star
city」公司案、挪用永豐餘資金承租上海1788 大樓等弊案，涉案不法金額超過數十億元。